Um menino fica órfão quando seu pai é assassinado. Vinte anos depois, o menino se tornou um lutador de artes marciais talentoso e mortal, movido pelo desejo de vingar seu pai. Para esconder sua verdadeira identidade, ele se autodenomina "Snake Eyes", um nome inspirado quando o assassino de seu pai o forçou a rolar um par de dados ponderados para determinar seu destino, matando-o quando ele rolou dois. Ele acaba chamando a atenção de um rico chefe da Yakuza, Kenta Takamura, que o descobre em um circuito de luta subterrâneo em Los Angeles. Kenta se oferece para encontrar o assassino de seu pai se Snake Eyes trabalhar para ele. Quando Snake Eyes aceita, ele é solicitado a provar sua lealdade atirando em um homem que traiu a confiança de Kenta, Snake Eyes se recusa e ajuda o traidor a escapar. O traidor é o primo de Kenta, Tommy. Os dois estavam na fila para liderar o clã Arashikage, uma antiga sociedade ninja dedicada a preservar a ordem e combater o mal. Agora Snake Eyes precisa provar se está ao alcance do nome que escolheu.